Bogdan Mănoiu a ocupat până în prezent funcţia de secretar de stat în cadrul MAEur. El a fost anterior şeful DAE, structură care s-a integrat în MAEur.
Mănoiu a mai lucrat la MAE, dar şi la Administraţia Prezidenţială, unde a fost, în perioada februarie – octombrie 2009, consilier de stat pentru relaţii internaţionale. În perioada iunie 2005 – decembrie 2008, Bogdan Mănoiu a fost de asemenea consilier în cadrul Administraţiei Prezidenţiale.